L'article L3111-4 du Code de la santé publique, modifié par le décret 2022-1296 du 7 octobre 2022 (et la loi du 30 décembre 2017 sur l'extension de l'obligation vaccinale infantile, décret 2017-1162 du 12 juillet 2017), impose quatre vaccinations principales aux professionnels exposés :

1. Hépatite B — obligatoire pour personnels soignants, étudiants en santé (médecine, pharmacie, dentaire, kiné, IFSI), biologistes, agents de prélèvement, ambulanciers, secouristes, gardes-malades à domicile, personnels SDIS exposés.

• Schéma classique 3 doses M0-M1-M6 (vaccins Engerix B ou HBVaxPro). Schéma accéléré M0-M1-M2 + rappel M12 possible si besoin ;
• Contrôle anti-HBs ≥ 10 UI/L = preuve de séroconversion (immunité protectrice à vie pour les vrais répondeurs) ;
• Non-répondeurs (5 à 10 % de la population) : schéma renforcé 4 doses ou vaccin adjuvanté HBVaxPro 40 µg. Si toujours négatif après 6 doses, professionnel considéré « non-répondeur définitif » — gestion des AES par TPE et immunoglobulines uniquement.

2. DTP (Diphtérie-Tétanos-Poliomyélite) — rappel adulte à 25, 45, 65 ans puis tous les 10 ans à partir de 65 ans (DT seul). Le tétanos par plaies du sol est particulièrement préoccupant en agriculture, BTP, espaces verts — d'où une vigilance accrue dans ces secteurs.

3. BCG — obligation supprimée pour le public général par le décret 2019-149 du 1^er mars 2019, mais maintenue dans deux cas :

• Personnels exerçant en zones où l'incidence TB > 30/100 000 (Île-de-France, Guyane, Mayotte) ;
• Personnels de laboratoires manipulant Mycobacterium tuberculosis (BSL-3).

4. COVID-19 — schéma vaccinal complet obligatoire pour les personnels soignants depuis le 1^er septembre 2021 (décret 2021-1059 du 7 août 2021, suite à la loi du 5 août 2021). Le décret 2022-1196 du 30 août 2022 a maintenu l'obligation. Sanction d'un refus : suspension du contrat de travail sans salaire jusqu'à régularisation (Cass. soc. confirme la légalité du dispositif dans plusieurs arrêts 2023).

Toute vaccination obligatoire est prise en charge par l'employeur (achat des vaccins, temps de vaccination considéré comme temps de travail, suivi sérologique) au titre de l'article R4426-6 du Code du travail.

Le calendrier vaccinal HCSP 2024 (Haut Conseil de la Santé Publique) précise les vaccinations recommandées selon les expositions professionnelles :

• Hépatite A — manipulation des eaux usées (égoutiers), agro-alimentaire en zone à risque, voyages, personnels de crèches et collectivités d'enfants. Schéma 2 doses M0-M6 (vaccin Havrix). Immunité durable (≥ 25 ans).
• Leptospirose — égoutiers, agriculteurs, éleveurs, vétérinaires, kayakistes pro et secouristes en milieu aquatique. Vaccin Spirolept 4 doses J0-J15-M2-M4 puis rappel à 2 ans (durée de protection ≈ 5 ans). 600 cas/an en France métropolitaine.
• ROR (Rougeole-Oreillons-Rubéole) — rattrapage adulte si né après 1980 et n'a pas reçu 2 doses. La rougeole est 16 fois plus contagieuse que la varicelle ; les épidémies en milieu hospitalier sont régulières.
• Coqueluche — rappel adulte tous les 20 ans, particulièrement pour les personnels santé, petite enfance, maternité (stratégie de cocooning du nourrisson).
• Varicelle — adultes non immunisés en professions petite enfance ou étudiants santé. Test sérologique préalable obligatoire.
• Grippe saisonnière — fortement recommandée à tous les personnels soignants chaque année. Couverture France 30 à 50 %, alors que l'objectif HCSP est de 80 à 90 %. Une couverture insuffisante en EHPAD est associée à une surmortalité documentée des résidents.
• Tuberculose / BCG : cf zone 1 — encore d'actualité pour certains profils.
• Rage — laboratoires manipulant le virus rabique, vétérinaires, agents de l'ONCFS et soigneurs de chiroptères. Schéma 3 doses J0-J7-J21/28.
• Typhoïde — voyages en zone d'endémie (Asie du Sud-Est, Afrique sub-saharienne), laboratoires manipulant Salmonella typhi.
• Encéphalite à tiques — forestiers, gardes-forestiers, militaires opérant en forêt européenne (Alsace, Allemagne, Autriche, Europe centrale). Vaccin FSME-Immun, schéma 3 doses puis rappel tous les 3-5 ans.

Le médecin du travail propose ces vaccinations recommandées au cas par cas selon l'évaluation du DUERP et la fiche d'exposition individuelle.

Le Suivi Individuel Renforcé (SIR) est régi par les articles R4624-22 à R4624-28 du Code du travail. Il s'applique aux salariés exposés à des risques particuliers, dont les agents biologiques des groupes 3 et 4 (article R4425-3).

Composantes du SIR :

1. Examen médical d'aptitude initial par le médecin du travail (et non plus un infirmier comme en surveillance simple), réalisé avant l'affectation au poste à risque ou au plus tard dans les 3 mois suivant l'embauche. Comprend des sérologies de base (VIH, VHB AgHBs et anti-HBs et anti-HBc, VHC, ROR, varicelle, parfois IDR tuberculine) ;
2. Visite périodique tous les 24 mois (vs 5 ans en surveillance simple), aménageable jusqu'à 36 mois si pas de nouvelle exposition ;
3. Examens complémentaires selon exposition :
   • IDR + IGRA (test interféron gamma, Quantiferon ou T-SPOT.TB) pour la tuberculose en laboratoire BSL-3 ;
   • Sérologies post-exposition (CMV, EBV, ROR si exposition pédiatrique) ;
   • Radiographie thoracique annuelle pour personnels en unité TB ;
   • EFR (épreuves fonctionnelles respiratoires) si exposition aux moisissures ou allergènes.
4. Fiche d'exposition individuelle (article R4425-3 Code du travail) : liste des agents biologiques manipulés, conditions, dates d'exposition, EPI portés. Conservation 40 ans minimum à compter de la fin de l'exposition ;
5. Avis d'aptitude ou d'inaptitude par le médecin du travail (apte, apte avec restrictions, inapte au poste).

Le non-respect du SIR par l'employeur constitue un manquement à l'obligation de sécurité (L4121-1) et expose à la qualification de faute inexcusable en cas de pathologie biologique avérée chez le salarié (rente majorée + indemnités préjudices personnels, jurisprudence constante Cass. soc.).

La pandémie COVID-19 (2020-2023) a profondément transformé la gestion des risques biologiques en France. Plusieurs dispositifs ont émergé ou ont été renforcés.

Plan pandémie national — piloté par le Premier ministre via le SGDSN (Secrétariat Général de la Défense et de la Sécurité Nationale), mis à jour 2024 post-COVID. Quatre phases :

1. Pré-pandémique : préparation, stocks stratégiques (masques FFP2/chirurgicaux, surblouses, antiviraux), surveillance internationale (WHO PIP Framework) ;
2. Alerte : réponse précoce, mesures de confinement local, cellules de crise ;
3. Pandémique : mobilisation maximale, gestion sanitaire, mesures barrières généralisées ;
4. Post-pandémique : levée progressive, retour d'expérience, reconstitution stocks.

Plan de Continuité d'Activité (PCA) — obligatoire pour les OIV (Opérateurs d'Importance Vitale) et fortement recommandé à toutes les entreprises. Le volet biosécurité d'un PCA inclut :

• Identification des activités critiques à maintenir en mode dégradé ;
• Bascule rapide en télétravail massif (procédures, équipements, sécurité IT) ;
• Stocks EPI stratégiques (masques, gants, lunettes, gel hydroalcoolique) en réserve 4-8 semaines ;
• Rotation des équipes en plateaux séparés pour limiter la contamination croisée ;
• Protocoles de désinfection renforcés et sas d'entrée si nécessaire ;
• Cellule de crise avec rôles et procédures préalablement définis.

Protection des soignants ayant contracté le COVID : le décret n° 2020-1131 du 14 septembre 2020 a créé le tableau de maladie professionnelle RG 100 (Régime Général n° 100) reconnaissant la COVID-19 comme maladie professionnelle pour les soignants ayant développé une affection respiratoire aiguë grave (oxygénothérapie ≥ 30 %, intubation ICU × 3 expositions documentées). Procédure simplifiée : pas besoin de prouver l'imputabilité au travail, présomption en faveur du soignant.

Préparation à l'antibiorésistance (AMR) — Plan AMR Anses 2022-2025 intégré dans la stratégie One Health. Surveillance des bactéries multirésistantes (BMR — Klebsiella pneumoniae carbapénémase, Acinetobacter baumannii résistant aux carbapénèmes, MRSA), promotion du bon usage des antibiotiques, R&D nouveaux antibiotiques. Enjeu mondial estimé à 10 millions de décès/an d'ici 2050 sans inflexion (étude Lord Jim O'Neill 2014, confirmée Lancet 2022).

La surveillance des menaces biologiques émergentes est coordonnée au niveau international par l'OMS, l'ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control) et au niveau français par Santé publique France, l'Anses, l'INSERM et l'Institut Pasteur. Plusieurs pathogènes sont en surveillance active en 2024-2025 :

• Grippe aviaire H5N1 clade 2.3.4.4b — virus animal devenu enzootique chez les bovins laitiers américains en 2024, > 200 cas humains documentés mondialement (souvent légers, conjonctivite). Risque de réassortiment avec grippe saisonnière humaine. Suivi WHO PIP Framework et stocks vaccinaux pré-pandémiques.
• Mpox (Monkeypox) clade I — réémergence 2024 en RDC (République Démocratique du Congo) avec un variant plus virulent que le clade IIb de l'épidémie 2022. Vaccination IMVANEX/Jynneos disponible pour personnels exposés et groupes à risque.
• Virus Nipah (Bangladesh, Inde) — épidémies sporadiques, létalité 40-75 %, transmission par chiroptères et homme-à-homme. Pas de vaccin, pas de traitement spécifique.
• Virus Marburg (Afrique sub-saharienne) — filoviridae proche d'Ebola, létalité ≈ 50 %. Plusieurs alertes Rwanda 2024 et Guinée équatoriale 2023.
• Fièvre de Lassa (Afrique de l'Ouest) — endémique, 100 000 à 300 000 cas/an, létalité hospitalière 15-20 %.
• MERS-CoV (Coronavirus du Moyen-Orient) — résurgences récurrentes en Arabie saoudite, létalité ≈ 35 %, vigilance Hajj.
• Polio sauvage et polio dérivée du vaccin (cVDPV) — surveillance OMS, dernières détections sporadiques Europe centrale 2022-2023.

Le cadre international de partage des souches et des données génomiques est le WHO PIP Framework (Pandemic Influenza Preparedness, adopté en 2011, mis à jour annuellement). Il garantit la transmission rapide des séquences génétiques aux laboratoires de référence (dont le CNR Influenza Institut Pasteur en France) et l'accès équitable aux contre-mesures (vaccins, antiviraux) en cas de pandémie déclarée.

Les institutions de référence à connaître pour tout responsable QSE/biorisque :

• HCSP (Haut Conseil de la Santé Publique) — recommandations sanitaires nationales ;
• Anses (Agence nationale de sécurité sanitaire) — évaluation des risques ;
• Santé publique France — surveillance épidémiologique nationale ;
• INSERM — recherche, dont GERES pour AES ;
• Institut Pasteur — Centres Nationaux de Référence (CNR), recherche fondamentale ;
• OMS (WHO) et ECDC — surveillance internationale.

Pour conformer l'entreprise aux obligations de vaccination, de SIR et de préparation pandémique, l'employeur doit s'organiser autour de cinq actions structurantes :

1. Cartographie des expositions — qui est exposé à quel groupe d'agents biologiques (1, 2, 3, 4) ? Tenir une liste nominative à jour (R4425-3), fiche d'exposition individuelle conservée 40 ans.
2. Plan vaccinal avec le médecin du travail — vaccinations obligatoires (Hépatite B, DTP, BCG si applicable, COVID-19), recommandées selon métier, contrôle sérologique post-vaccinal (anti-HBs ≥ 10 UI/L pour Hépatite B).
3. SIR opérationnel — visites M0, périodicité 24 mois, sérologies, IDR/IGRA TB selon poste, gestion des inaptitudes. Convention avec un SPST (Service de Prévention et de Santé au Travail).
4. PCA biosécurité — identification des activités critiques, stocks EPI, télétravail, cellule de crise, protocoles désinfection. Test annuel exercice de simulation.
5. Veille réglementaire et épidémiologique — abonnement aux alertes Santé publique France, HCSP, ECDC. Mise à jour du DUERP au moins annuellement et systématiquement après alerte.

Rôle du référent biosécurité — recommandé dans les établissements de santé et laboratoires BSL-2/3 (pas d'obligation légale générale mais bonne pratique). Le référent assure l'interface entre direction, service de santé au travail, CSE/CSSCT et autorités sanitaires.